home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00397 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  33 lines
  1. *******************************************
  2. * Bacterial luciferase subunits signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Luminous bacteria  are  abundant and  widely distributed  gram negative motile
  6. rods. The enzyme responsible for bioluminescence, bacterial luciferase [1,2,3]
  7. (EC 1.14.14.3),  catalyzes  the  oxidation  of  reduced  riboflavin  phosphate
  8. (FMNH2) and  a long chain fatty aldehyde with the emission of blue green light
  9. (490 nm).  Luciferase  is  a heterodimeric enzyme composed of an alpha subunit
  10. (gene luxA)  and a beta subunit (gene luxB).  The  two subunits appear to have
  11. arisen by gene duplication.
  12.  
  13. The bioluminescence operon of some species of Photobacterium encodes a protein
  14. known as  the  non-fluorescent  flavoprotein  (NFP)  (gene  luxF).  NFP, whose
  15. function is not yet known, contains an unusual non-covalently bound flavin. It
  16. is evolutionary related to the luxA/luxB subunits.
  17.  
  18. As a signature for this family, we selected  a conserved region located in the
  19. central part of these proteins.
  20.  
  21. -Consensus pattern: [GA]-[LIVM]-P-[LIVM]-x-[LIVMFY]-x-W-x(6)-[RK]-x(6)-Y-x(3)-
  22.                     [AR]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: June 1994 / Text revised.
  26.  
  27. [ 1] Meighen E.A.
  28.      Microbiol. Rev. 55:123-142(1991).
  29. [ 2] Meighen E.A.
  30.      FASEB J. 7:1016-1022(1993).
  31. [ 3] O'Kane D.J.O., Prasher D.C.
  32.      Mol. Microbiol. 6:443-449(1992).
  33.